Точная дата основания Свято-Николо-Шартомского монастыря утеряна, однако известно, что он был основан на месте обретения иконы Николая Чудотворца во время правления Василия Темного. По легенде, одна благочестивая крестьянка, придя за водой на реку Шартому, нашла небольшую иконку святого Николая. Она отнесла ее домой, но на следующее утро святой образ пропал. Позднее его нашли на болотистом месте прислоненным к одной из кочек. Это событие посчитали «знаком», и поэтому здесь была создана Святая обитель.

Монастырь находится при впадении р. Молохты в р. Теру. Места здесь очень живописные. Николо-Шартомский мужской монастырь – одна из старейших обителей центральной России, имеет статус памятника федерального значения.

На монастырской территории построено четыре храма: собор во имя святого Николая Чудотворца; церковь во имя св. Григория Акрагантийского и Преображенская церковь над Святыми вратами, а также Казанская церковь. Главными святынями монастыря считается явленный образ Святителя Николая Чудотворца, а также находящаяся в этой обители икона Казанской Божией Матери. В Советское время обитель была закрыта, а строения переданы местным властям. Долгое время храмы использовались не по своему прямому назначению: под зернохранилища, склады, частично под жилье.

В 1990 г. монастырь был возвращен РПЦ. Из древних образцов зрдчества и архитектуры здесь сохранились Никольский собор, церкви Казанская, Григория Аграгантийского и Преображения, колокольня, кельи, настоятельский корпус и ограда. С 2012 г. здесь находится епархиальное управление новоучрежденной Шуйской епархии. В монастырском здании живут сейчас около 100 монахов, обитель преображается прямо на глазах. На его территории монастыря есть свой коровник, птичник, разводят лошадей, рыбу, занимаются земледелием и пчеловодством.

В наши дни Свято-Николо-Шартомский мужской монастырь является действующим, ведутся церковные службы, просветительская и благотворительная деятельность. При монастыре действует школа-интернат. Монастырь не является туристическим объектом, посещение церкви прихожанами разрешено только во время службы.